Джованни де Бернадоне родился в 1182 году в Ассизи, сын сира Пьетро де Бернадоне, богатого купца, который вел большие дела с Провансом. Там Пьетро влюбился во француженку Пику и привез ее в Ассизи в качестве жены. Когда он вернулся из очередной поездки в Прованс и обнаружил, что у него родился сын, он переименовал ребенка в Франческо, Франциска, видимо, в знак уважения к Пике. Мальчик вырос в одном из прекраснейших регионов Италии и никогда не терял своей привязанности к умбрийским пейзажам и небу. Итальянский и французский языки он выучил от родителей, а латынь — от приходского священника; дальнейшего формального образования у него не было, но вскоре поступил на службу к отцу. Он разочаровал сира Пьетро, проявив больше умения тратить деньги, чем зарабатывать их. Он был самым богатым юношей в городе и самым щедрым; вокруг него собирались друзья, с ним ели и пили, с ним пели песни трубадуров; Франциск то и дело надевал разноцветный костюм менестреля.36 Он был симпатичным мальчиком, с черными глазами и волосами, добрым лицом и мелодичным голосом. Его ранние биографы утверждают, что у него не было никаких отношений с представителями другого пола, и, более того, он знал в лицо только двух женщин;37 Но это, несомненно, делает Фрэнсиса несправедливым. Возможно, в те годы он слышал от своего отца об альбигойцах и вальденсах, еретиках южной Франции, и их новом евангелии евангельской бедности.
В 1202 году он сражался в составе ассизской армии против Перуджи, попал в плен и провел год в медитативном плену. В 1204 году он присоединился в качестве добровольца к армии папы Иннокентия III. В Сполето, лежа в постели с лихорадкой, ему показалось, что он слышит голос, спрашивающий его: «Почему ты покидаешь господина ради слуги, а князя ради его вассала?» «Господи, — спросил он, — что ты хочешь, чтобы я сделал?» Голос ответил: «Возвращайся в свой дом; там тебе скажут, что тебе делать».38 Он покинул армию и вернулся в Ассизи. Теперь он проявлял все меньше интереса к делам отца и все больше — к религии. Недалеко от Ассизи находилась бедная часовня святого Дамиана. Молясь там в феврале 1207 года, Франциск подумал, что слышит, как Христос обращается к нему с алтаря, принимая его жизнь и душу в качестве жертвы. С этого момента он почувствовал, что посвятил себя новой жизни. Он отдал священнику часовни все деньги, которые у него были с собой, и отправился домой. Однажды он встретил прокаженного и с отвращением отвернулся. Упрекая себя в неверности Христу, он вернулся, вытряхнул свой кошелек в руку прокаженного и поцеловал ее; этот поступок, по его словам, ознаменовал эпоху в его духовной жизни.39 После этого он часто посещал жилища прокаженных и приносил им милостыню.
Вскоре после этого он провел несколько дней в часовне или рядом с ней, почти ничего не ел; когда он снова появился в Ассизи, он был так худ, изможден и бледен, его одежда была так изорвана, а разум так помутился, что урбаны на площади кричали: «Паццо! Паццо! — «Безумец! Безумец!» Там его нашел отец, назвал полудурком, притащил домой и запер в чулане. Освобожденный матерью, Франциск поспешил обратно в часовню. Разгневанный отец догнал его, отчитал за то, что его семья стала предметом всеобщего посмешища, упрекнул в том, что деньги, потраченные на его воспитание, приносят столь малую прибыль, и велел покинуть город. Франциск продал свои личные вещи, чтобы поддержать часовню; он передал вырученные деньги отцу, который принял их; но он не признавал власти отца, чтобы командовать тем, кто теперь принадлежал Христу. Призванный в трибунал епископа на площади Санта-Мария-Маджоре, он смиренно предстал перед ним, а толпа наблюдала за этой сценой, запомнившейся кисти Джотто. Епископ поверил ему на слово и заставил отказаться от всего своего имущества. Франциск удалился в одну из комнат епископского дворца и вскоре появился вновь, совершенно обнаженный; он положил перед епископом свою одежду и несколько оставшихся монет и сказал: «До сих пор я называл Пьетро Бернадоне своим отцом, но теперь я хочу служить Богу. Поэтому я возвращаю ему эти деньги… а также одежду и все, что я имел от него; ибо отныне я хочу говорить только «Отче наш, сущий на небесах»».40 Бернадоне унес одежду, а епископ накрыл дрожащего Франциска своей мантией. Франциск вернулся в монастырь святого Дамиана, сшил себе отшельническую мантию, выпрашивал еду от двери к двери и своими руками начал восстанавливать разрушающуюся часовню. Несколько горожан пришли помочь ему, и они вместе пели во время работы.
В феврале 1209 года, служа мессу, он был поражен словами, которые священник прочитал из наставлений Иисуса апостолам:
И, идя, проповедуйте, говоря: «Приблизилось Царство Небесное». Исцеляйте больных, очищайте прокаженных, воскрешайте мертвых, изгоняйте бесов. Даром получили, даром давайте. Не имейте в кошельках ни золота, ни серебра, ни меди, ни денег на дорогу, ни двух одежд, ни обуви, ни посоха» (Матф. x, 7-10). (Матф. x, 7-10.)